1. 自身内容角度

重复率问题 如果拆分发表的小论文内容大量重复出现在后面博士论文中，会提高重复率。尤其是一些实验数据、结论方法如果没有经过合理修改和阐述直接使用，很可能被查重系统判定为重复。以某校博士将部分数据和结论直接从小论文挪移到博士论文中为例，忽略了不同主体、不同格式要求等情况下查重系统的精细检测规则，就造成了博士论文重复率过高()。

引用规范性 合理引用自己发表的小论文对于不增加重复率至关重要。如果引用自身小论文时没有正确标注参考文献或者未按照学校相关要求进行规范引用，在博士论文查重时可能出现误判为抄袭的情况。比如在撰写博士论文时虽引用自己在核心期刊先发表的小论文中的一些观点，但是没有对引用处做特殊处理且不符合学校“必须在引用处注明作者（本人）、文章发表来源和时间”等细化引用规则，导致重复率计算错误()。

内容完整性和一致性 从完整性角度，如果先将核心关键内容都作为小论文发表了，那么博士论文主体可能会显得内容空洞或者逻辑连贯性出现问题。虽然不一定和查重直接相关，但这会使后续博士论文质量评估受到影响，导师或评委可能怀疑整个博士期间的研究成果深度和系统性。从一致性角度，如果作为小论文中的局部内容初创阶段相对简略粗糙，在扩充为博士论文时大量改动，可能导致本身逻辑性不一致，在查重时部分语句的通顺连贯性等问题可能也会影响系统对原创性的判断()。

2. 格式角度

格式要求也是影响博士论文查重的重要因素，如果格式不符合要求，可能会导致查重系统无法正确识别引用内容，从而导致查重率过高。不同的学校和机构对论文格式的要求不同，当发表的小论文和博士论文格式不一致时分会严重影响到后期博士论文总体的查重情况。比如小论文采用了某行业期刊要求的简略格式如只有部分参考文献在文末用简单格式列出，而博士论文学校要求必须在正文中对应位置详细标注参考文献且采用特定的编码体系，如果整合二者时没有对格式进行针对性调整，很可能会给查重带来困扰()。

3. 学科分类角度

人文社科类 对于人文社科类学科的博士论文，如果拆分小论文发表，在引用规范、重复率等方面依然遵循以上普遍规则。但是由于其研究成果很多时候更侧重文字性的理论和观点表述，如果不能很好对涉及小论文中自身原创观点进行灵活引用和阐述，就很容易出现重复内容过高情况。例某文史专业博士在小论文中将自己关于某个历史阶段特定研究的核心观点作为定论先行发表，但在博士论文中没有更好地对其进一步深化和创新表达，只是重述观点并加上了一些周边辅助介绍，也未从新的角度证明，就会在查重上出问题()。

理工类 理工类的博士论文往往涉及大量的数据图表和实验研究过程。如果拆分小论文发表时，对于数据图表使用不合理（例如大量截取图表而不进行新的补充说明和parameter优化调整）和实验过程解释不足（在小论文中只简述初步实验结论缺乏中间环节和实验可优化方向介绍等）可能在博士论文查重时面临挑战。因为后续博士论文中重复的图片、视频以及按照小论文快速拼凑起来的实验环节很容易被查重系统识别。例如某生物专业博士从博士论文中截取部分实验图作为小论文发表，但在博士论文中重新插入该部分实验图时没有合理说明导至图片查重出现风险，同时因为早期实验环节在小论文表达上的局限性导致和博士论文中扩展开来的正常实验流程存在连贯性不一致情况，更会使系统对该部分内容的正确性产生怀疑().

4. 查重系统角度

目前市面上有很多不同的查重系统，每个系统都有自己的算法和标准，这也会影响到博士论文拆分小论文先发对查重的结果。例如知网，他们在检测重复率时对文字、图片、表格等内容的识别程度以及对引用文献和网络内容的比对方式都可能会对博士论文含有先发小论文的查重结果造成影响()。有些查重系统可能对特定学科的特征内容检测不太准确（如对某些学科的专业术语或者图表格式的不敏感），如果博士论文先以小论文形式在某个匹配度不高的系统使用的格式发表内容后，再到一个更权威需要进行最终博士论文评估的查重系统中进行检测，就可能出现查重复率异常（过高或过低都有可能）情况。